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问题起因：
今天做了一件事情：我在VM 上将一数据库的数据文件（/var/lib/mysql整个文件夹）拷贝到另外一台VM上，然后新的VM 上启动MYSQL，结果报如下异常：
[root@localhost mysql]# service mysql start
Starting MySQL.. ERROR! The server quit without updating PID file (/var/lib/mysql/localhost.localdomain.pid).
于是Google之，大部分的答案都是：
1. 注释/etc/my.cnf里的skip-federated注释掉即#skip-federated；
2. my.cnf文件配置过高，重新定义其中的参数（根据服务器情况定义）；
3. 杀掉mysql_safe和mysqld进程，然后再重启；
4. 当前日志文件过大，超出了my.cnf中定义的大小（默认为64M），删除日志文件再重启；

5. 其他情况，查看日志文件（我的是localhost.localdomain.err，具体因人而异），然后具体分析；

问题解决：

其中，我查看了日志内容，如下：

[root@localhost mysql]# less localhost.localdomain.err 
111203 22:09:03 mysqld_safe Starting mysqld daemon with databases from /var/lib/mysql
^G/usr/sbin/mysqld: File './mysql-bin.index' not found (Errcode: 13)
111203 22:09:03 [ERROR] Aborting

111203 22:09:03 [Note] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete

111203 22:09:03 mysqld_safe mysqld from pid file /var/lib/mysql/localhost.localdomain.pid ended

但是我查看了我的目录文件，mysql-bin.index文件是存在的呀，奇怪：

[root@localhost mysql]# ll
total 49828
-rw-rw----. 1 mysql mysql 35651584 Dec  3 17:55 ibdata1
-rw-rw----. 1 mysql mysql  5242880 Dec  3 17:55 ib_logfile0
-rw-rw----. 1 mysql mysql  5242880 Dec  3 15:45 ib_logfile1
-rw-rw----. 1 mysql root      1376 Dec  3 22:02 localhost.localdomain.err
drwx--x--x. 2 mysql mysql     4096 Dec  3 17:55 mysql
-rw-rw----. 1 mysql mysql  4847020 Dec  3 17:55 mysql-bin.000001
-rw-rw----. 1 mysql mysql     1373 Dec  3 17:56 mysql-bin.000002
-rw-r--r--. 1 root  root        19 Dec  3 15:38 mysql-bin.index
drwx------. 2 mysql mysql     4096 Dec  3 17:55 performance_schema
-rw-r--r--. 1 root  root       116 Nov 25 21:03 RPM_UPGRADE_HISTORY
-rw-r--r--. 1 mysql mysql      116 Nov 25 21:03 RPM_UPGRADE_MARKER-LAST
drwxr-xr-x. 2 mysql mysql     4096 Dec  3 17:55 test

仔细看了下，咦？-rw-r--r--. 1 root  root        19 Dec  3 15:38 mysql-bin.index----难道是权限不够？于是将该文件加了写权限，重启，涛声依旧！！！噢噢！

难道是编码问题？难道是....继续猜测。。。问题还是没解决，后来我做了一件事情，将mysql-bin.index文件删除掉！重启！！OH！No！！

[root@localhost mysql]# rm -rf mysql-bin.index 
[root@localhost mysql]#  
[root@localhost mysql]# service mysql start
Starting MySQL... SUCCESS! 

就这样？？为什么呢？至今这个仍然是未解之谜（对我来说），如有知情者请告知：）

补充：

很多时候，我们在做主从同步的时候，将数据库目录整体打包拷贝到从机上的时候，重启也往往会出现类似的问题，解决方法仍然是：

1）给MYSQL数据库数据目录权限：chown -R mysql:mysql 目录名称

2）务必保证MYSQL的进程是已经关闭了的；

另外要注意的地方就是：ib_*, mysql-bin-*, *.err(log文件)以及master-info和relay-info文件都是可以删除的，相当于重新初始化数据库的数据，但是前提是：

1）操作前要先关掉MYSQL的进程；

2）删掉文件后要重新启动MYSQL，如果有异常，请自行查看日志找问题，一般都比较好定位和解决。